Muitas substâncias que passam pelo complexo golgiense (Ver também Aparelho de Golgi) saem da célula e vão atuar em diferentes locais do corpo do organismo multicelular. É o que ocorre, por exemplo, com as enzimas digestivas, produzidas e secretadas pelas células do pâncreas e que irão atuar no intestino.
Além de enzimas, outras substâncias de natureza protéica, como hormônios e muco, também são secretadas pelo complexo golgiense. O processo de produção e eliminação dessas substâncias constituem a secreção celular.