Apomorfia significa uma característica nova ou derivada de certos grupos. As características apomórficas são deduzidas a partir de estudos de anatomia comparada. As caracteristicas escolhidas devem ser HOMÓLOGAS. Exemplo na imagem a seguir. (Ver também Plesiomorfia)
Cladograma.png
nesse caso, as apomorfias são os nomes antre os animais comparados.